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Quick-16S NGS Library Prep Kit 96 preps - Zymo

Quick-16S NGS Library Prep Kit 96 preps - Zymo

Cód.: D6400   |   Vendido por:  Veritas
Varejo

R$ 12.000,00

R$ 7.800,00

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Descrição do produto

  • Mais rápido: apenas 1,5 horas de tempo prático. Sem análise Tapestation® ou limpezas AMPure®.
  • Exato: a utilização de PCR em tempo real limita a formação de quimera de PCR.
  • Maior Cobertura: Novos primers aumentam a cobertura filogenética de Bactérias e Archaea e permitem a resolução em nível de espécie para o perfil do microbioma humano.

O sequenciamento de 16S rRNA é uma técnica de rotina para o perfil de composição do microbioma. Comparado com o sequenciamento metagenômico shotgun, o sequenciamento 16S rRNA é mais econômico e mais robusto; geralmente requer menos entrada de DNA e é menos impactado pela presença do DNA do hospedeiro. No entanto, o sequenciamento do rRNA 16S tem seus próprios desafios.

Um grande desafio é a formação de sequências quiméricas de PCR, que são sequências artificiais resultantes da recombinação de dois ou mais modelos de PCR. Além disso, com primers 16S comuns, é difícil atingir a resolução em nível de espécie e ampla cobertura filogenética. Além disso, os protocolos de preparação de biblioteca 16S comuns usados ​​no campo não foram otimizados para serem econômicos para aplicações em grande escala.

O Quick-16S NGS Library Prep Kit visa padronizar o processo de preparação da biblioteca para o sequenciamento de rRNA 16S. As características distintivas do kit são descritas abaixo. Fastest 16S rRNA Library Prep. O Quick-16S NGS Library Prep Kit utiliza PCR em tempo real (quantitativo) (qPCR) em vez de PCR de endpoint para amplificação de 16S rRNA, permitindo a quantificação direta de produtos de PCR e eliminando a necessidade de análise de quantificação de biblioteca adicional, como análise TapeStation ou eletroforese em gel. Uma limpeza enzimática é introduzida entre as duas etapas de PCR, economizando tempo e reduzindo custos em comparação com limpezas baseadas em esferas AMPure demoradas. Com esses recursos, o kit reduz drasticamente o tempo de preparação da biblioteca 16S.

Simples. O Quick-16S NGS Library Prep Kit inclui todos os reagentes necessários para converter 96 amostras de DNA em uma biblioteca 16S. A biblioteca resultante é diretamente compatível com o Illumina MiSeq sem a necessidade de primers de sequenciamento personalizados adicionais.

Preciso. A utilização de PCR em tempo real também permite que os usuários controlem os ciclos de PCR. Isso limita a formação de quimera e o viés de PCR ao obter produtos suficientes para o sequenciamento subsequente. Na maioria dos casos, a abundância de sequências quiméricas de PCR é mantida abaixo de 2%.

Maior cobertura. Devido à rápida expansão dos bancos de dados de rRNA 16S, a cobertura microbiana insuficiente de conjuntos de primers 16S comuns tornou-se evidente. A Zymo Research redesenhou dois conjuntos de primer comuns visando as regiões 16S V1-V2 e 16S V3-V4 com base no banco de dados de referência 16S mais atualizado e melhorou significativamente sua cobertura.

Conteúdo do kit: Quick-16S™ NGS Library Prep Kit..D6400-A  x 1 (Dry Ice) D6400-B x 1 (Dry Ice) D6400-C x 1 (Room Temp.) , D6400, Zymo, Room Temp & Dry Ice Items, -70C & RT

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